Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PLNP26678 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PLNP26678 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PLNP26678 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PLNP26678 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PLNP26678 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PLNP26678 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PLNP26678 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PLNP26678 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLNP26678 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLNP26678 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PLNP26678 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLNP26678 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLNP26678 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLNP26678 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLNP26678 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLNP26678 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms