Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTSSP25774 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSSP25774 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSSP25774 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSSP25774 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSSP25774 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTSSP25774 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTSSP25774 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSSP25774 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSSP25774 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms