Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms