Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2P22307 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2P22307 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCP2P22307 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCP2P22307 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2P22307 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2P22307 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2P22307 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2P22307 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms