Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSR1P21757 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSR1P21757 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSR1P21757 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSR1P21757 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSR1P21757 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms