Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK11BP21127 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms