Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFE3P19532 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFE3P19532 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFE3P19532 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TFE3P19532 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFE3P19532 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFE3P19532 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFE3P19532 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFE3P19532 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFE3P19532 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFE3P19532 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFE3P19532 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFE3P19532 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFE3P19532 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFE3P19532 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFE3P19532 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms