Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBTFP17480 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBTFP17480 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBTFP17480 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBTFP17480 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBTFP17480 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBTFP17480 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBTFP17480 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBTFP17480 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBTFP17480 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBTFP17480 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
UBTFP17480 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
UBTFP17480 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
UBTFP17480 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
UBTFP17480 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
UBTFP17480 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
UBTFP17480 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
UBTFP17480 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
UBTFP17480 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
UBTFP17480 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBTFP17480 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBTFP17480 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBTFP17480 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBTFP17480 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBTFP17480 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBTFP17480 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBTFP17480 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBTFP17480 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBTFP17480 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBTFP17480 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBTFP17480 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBTFP17480 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBTFP17480 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBTFP17480 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBTFP17480 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBTFP17480 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBTFP17480 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UBTFP17480 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
UBTFP17480 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
UBTFP17480 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
UBTFP17480 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
UBTFP17480 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
UBTFP17480 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
UBTFP17480 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
UBTFP17480 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
UBTFP17480 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
UBTFP17480 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
UBTFP17480 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
UBTFP17480 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
UBTFP17480 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
UBTFP17480 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
UBTFP17480 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
UBTFP17480 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
UBTFP17480 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
UBTFP17480 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
UBTFP17480 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms