Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPD1P17405 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms