Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A2P16615 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms