Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPB42P16452 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPB42P16452 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPB42P16452 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPB42P16452 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPB42P16452 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPB42P16452 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPB42P16452 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPB42P16452 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPB42P16452 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPB42P16452 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPB42P16452 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPB42P16452 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPB42P16452 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPB42P16452 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPB42P16452 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPB42P16452 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EPB42P16452 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPB42P16452 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPB42P16452 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPB42P16452 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPB42P16452 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPB42P16452 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPB42P16452 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms