Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ODC1P11926 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ODC1P11926 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODC1P11926 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODC1P11926 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODC1P11926 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODC1P11926 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms