Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41P11171 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41P11171 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41P11171 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41P11171 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41P11171 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41P11171 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41P11171 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41P11171 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41P11171 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41P11171 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB41P11171 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB41P11171 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41P11171 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41P11171 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41P11171 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms