Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2P10911 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCF2P10911 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCF2P10911 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCF2P10911 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCF2P10911 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2P10911 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2P10911 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2P10911 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2P10911 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2P10911 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2P10911 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2P10911 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2P10911 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms