Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD28P10747 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD28P10747 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD28P10747 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD28P10747 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD28P10747 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms