Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LYNX1P0DP58 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYNX1P0DP58 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms