Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms