Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB7P09629 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms