Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VIL1P09327 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIL1P09327 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIL1P09327 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIL1P09327 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIL1P09327 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIL1P09327 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIL1P09327 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VIL1P09327 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIL1P09327 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIL1P09327 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VIL1P09327 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIL1P09327 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIL1P09327 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIL1P09327 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VIL1P09327 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIL1P09327 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms