Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PKHD1P08F94 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PKHD1P08F94 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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