Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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