Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms