Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV1-17P01599 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms