Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSD2O96028 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD2O96028 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD2O96028 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD2O96028 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD2O96028 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD2O96028 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD2O96028 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD2O96028 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD2O96028 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD2O96028 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD2O96028 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NSD2O96028 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSD2O96028 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSD2O96028 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSD2O96028 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSD2O96028 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSD2O96028 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSD2O96028 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSD2O96028 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NSD2O96028 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSD2O96028 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms