Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms