Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLSTN1O94985 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLSTN1O94985 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms