Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF6O75683 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF6O75683 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF6O75683 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF6O75683 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF6O75683 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF6O75683 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SURF6O75683 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms