Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM4AO75164 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms