Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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PRAMEF10O60809 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF10O60809 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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PRAMEF10O60809 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF10O60809 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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