Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KIAA0556O60303 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KIAA0556O60303 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms