Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX6O43752 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX6O43752 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX6O43752 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX6O43752 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX6O43752 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX6O43752 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX6O43752 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX6O43752 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX6O43752 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX6O43752 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX6O43752 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX6O43752 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX6O43752 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms