Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRC1O43663 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRC1O43663 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRC1O43663 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRC1O43663 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRC1O43663 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms