Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASA4O43374 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RASA4O43374 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RASA4O43374 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RASA4O43374 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RASA4O43374 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RASA4O43374 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RASA4O43374 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RASA4O43374 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RASA4O43374 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASA4O43374 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASA4O43374 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASA4O43374 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms