Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB6O15197 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB6O15197 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms