Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD28O15084 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD28O15084 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD28O15084 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD28O15084 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms