Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNMO15061 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNMO15061 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNMO15061 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNMO15061 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNMO15061 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNMO15061 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNMO15061 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNMO15061 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNMO15061 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNMO15061 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNMO15061 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNMO15061 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNMO15061 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNMO15061 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNMO15061 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNMO15061 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNMO15061 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNMO15061 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNMO15061 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNMO15061 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNMO15061 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNMO15061 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNMO15061 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNMO15061 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNMO15061 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNMO15061 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNMO15061 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNMO15061 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms