Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF646O15015 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF646O15015 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF646O15015 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF646O15015 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF646O15015 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF646O15015 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF646O15015 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF646O15015 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF646O15015 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms