Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAMP3O14828 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP3O14828 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms