Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGPD8O14715 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms