Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PODXLO00592 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PODXLO00592 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PODXLO00592 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PODXLO00592 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PODXLO00592 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PODXLO00592 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PODXLO00592 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PODXLO00592 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PODXLO00592 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PODXLO00592 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PODXLO00592 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PODXLO00592 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXLO00592 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXLO00592 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXLO00592 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXLO00592 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXLO00592 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PODXLO00592 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms