Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOC4-APOC2K7ER74 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms