Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C6orf229H3BNL8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms