Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms