Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms