Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms