Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF3BA8MYP8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms