Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms