Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DBX1A6NMT0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DBX1A6NMT0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms