Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC69A6NI79 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms