Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STRCP1A6NGW2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCP1A6NGW2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCP1A6NGW2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCP1A6NGW2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCP1A6NGW2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCP1A6NGW2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCP1A6NGW2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCP1A6NGW2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STRCP1A6NGW2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms